La Contraloría General de la República advirtió que 32 obras públicas ejecutadas entre 2020 y 2025 bajo la modalidad de Gobierno a Gobierno (G2G) registraron un incremento de 140.7 % en sus costos y una ampliación de 332.6 % en sus plazos de ejecución respecto a lo establecido inicialmente en los contratos. Según el informe de auditoría, las inversiones destinadas a la reconstrucción y prevención por los daños del Fenómeno de El Niño Costero no alcanzaron los niveles de economía ni de eficacia previstos. El organismo de control señaló que estos proyectos estuvieron inicialmente a cargo de la Autoridad para la Reconstrucción con Cambios (ARCC) y luego fueron transferidos a la Autoridad Nacional de Infraestructura (ANIN). Solo 32 de las 141 inversiones ejecutadas bajo este esquema habían alcanzado el cierre comercial hasta diciembre de 2025.
Las obras pasaron de un presupuesto contractual acumulado de S/ 843 millones a un costo final de S/ 2029 millones, es decir, más del doble de lo previsto. Entre los casos más representativos figura la protección contra inundaciones de la quebrada El León, en La Libertad, cuyo costo aumentó de S/ 473 millones a S/ 818 millones. También destaca la Institución Educativa N.° 80374 José Sevilla Escajadillo, en Pacasmayo, cuya inversión pasó de S/ 11.7 millones a S/ 62 millones. La Contraloría explicó que estas variaciones fueron posibles debido a los denominados "eventos compensables" contemplados en los contratos NEC3.
En cuanto a los plazos, las 32 obras debían ejecutarse en un total de 4414 días, pero finalmente demandaron 19 093 días, más de tres veces el tiempo previsto. Las mayores demoras se registraron en proyectos educativos, obligando a miles de estudiantes a recibir clases en locales provisionales durante varios años. En Piura y La Libertad se reportaron instituciones educativas que pasaron de plazos de entre 120 y 165 días a más de 970 y hasta 1036 días para culminar su reconstrucción. La auditoría concluyó que estas demoras afectaron directamente a miles de ciudadanos que esperaban infraestructura esencial.
El informe también identificó que los principales factores de las ampliaciones fueron modificaciones en los diseños, condiciones técnicas y físicas no previstas, interferencias de terceros y riesgos climáticos o sanitarios. Solo en seis proyectos analizados se aprobaron 140 eventos compensables que generaron un sobrecosto de S/ 381 millones y una ampliación acumulada de 2860 días. Para la Contraloría, estas situaciones evidencian limitaciones en la planificación y en la gestión de riesgos de este modelo de contratación, lo que podría comprometer futuras inversiones públicas. El organismo exhortó a fortalecer los mecanismos de control para garantizar que las obras se ejecuten dentro de los costos y plazos comprometidos.

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